Desa Sangkima dalam struktur pemerintahan daerah Kalimantan Timur merupakan desa yang termasuk dalam wilayah Kecamatan Sangatta Selatan, Kabupaten Kutai Timur, Provinsi Kalimantan Timur. 

Dengan Batas-batas wilayah (tahun 2022) sebagai berikut :

Sebelah Utara         : Desa Sangatta Selatan dan Kelurahan Singa Geweh

Sebelah Selatan     : Desa Teluk Singkama

Sebelah Barat         : Muara Bengkal

Sebelah Timur        : Selat Makassar

Jarak pusat desa ini dengan Kecamatan sekitar 17 Km dan 35 Km jarak dari pusat pemerintahan Kabupaten Kutai Timur. Desa Sangkima dapat ditempuh dengan perjalanan darat dengan waktu kurang lebih 45 menit hingga 1,5 jam. 

Keadaan Topografi Desa Sangkima merupakan dataran rendah, dataran tinggi dan pantai dengan ketinggian tanah 0-50 m diatas permukaan laut. Suhu udara rata-rata 29 derajat Celcius. Curah hujan berkisar antara 110 mm tahun-1 sampai 114 mm tahun-1 (Profil Desa Sangkima, 2017).